Eine Repetierpipette kann in allen Anwendungen oder Arbeitsabläufen eingesetzt werden, die eine Replikation des Assays erfordern, oder in Fällen, in denen die Genauigkeit und Präzision innerhalb der Proben entscheidend sind. Zum Beispiel bevorzugen viele Pipettenbenutzer Repetierpipetten für die Vorbereitung von PCR-Reaktionen. Repetierpipetten können das gleiche Volumen des PCR-Reaktionsmixes in jedes PCR-Gefäß abgeben.
Eine weitere häufige Anwendung ist das Aliquotieren von kritischen Reagenzien oder Proben in Gefäße für die Langzeitlagerung, wie z. B. Serum von einem Patienten, das eingefroren werden muss. Wenn eine solche Probe einfach in einem großen Volumen eingefroren wird, können unnötige Auftauzyklen die Integrität der Probe/Biomarker, die temperaturempfindlich sind, beeinträchtigen.
Außerdem sind Proben mit hoher Viskosität oder Volatilität in der Regel schwer mit Luftpolsterpipetten zu pipettieren. Das liegt daran, dass die Kräfte, die diese Flüssigkeiten auf das Luftpolster zwischen dem Kolben und der Flüssigkeit in Luftpolsterpipetten ausüben, zu einer unzureichenden Probe-zu-Probe Wiederholbarkeit führen (schlechte Genauigkeit und Präzision). Repetierpipetten verbessern die Genauigkeit und Präzision in Anwendungen oder Protokollen mit anspruchsvollen Flüssigkeiten erheblich.